Tuesday, February 1, 2011

БИОМЕДИЦИНА
Пересадка Микробы Gut для лечения болезней


ЧЕТВЕРГЕ, 2 СЕНТЯБРЯ 2010ПО КАРЕН ВАЙНТРАУБ
Исследователи предположили, что первоначально трансплантации помогло бы сначала очистка кишки получателя микробов антибиотиками, в соответствии с Manichanh. Но они обнаружили, что антибиотики были настолько сильны, что они мешали созданию новых микробных колоний. Крыс, которые не получают антибиотики показали больше изменений в их флоры, чем те, что сделали.

Джордж М. Вайншток , профессор генетики в Университете Вашингтона в Сент-Луисе и заместитель директора школы геноме центра, говорит, что это слишком рано говорить ли подобные трансплантации будет работать в людей, и если это так, для которых заболеваний. Хотя анекдотических эксперименты показали, что кто-то микробиомом изменение может быть лечение болезни, окончательного экспериментов не хватает, говорит он.
Дэвид А. Relman , профессор медицины и микробиологии и иммунологии в Стэнфордском университете, говорит, что это также по-прежнему, будет ли трансплантации могут быть стандартизированы для получения надежных и воспроизводимых результатов. Как чужой микробов кишки может предположительно, положительное влияние на расстройства, связанные бактериального роста, но также может иметь потенциально опасные последствия. Это новое исследование следует крыс на три месяца и обнаружили, что новые колонии микробов были стабильными. Но будущие исследования должны будут следовать реципиентов на более длительный срок, Relman говорит.

Следующим шагом в своих исследованиях, Manichanh говорит, является ли микробиомом трансплантации могут повлиять на ход болезни больного животного. Она и ее команда первый план, чтобы посмотреть на синдром раздраженной толстой кишки. Они уже работают в каталог микробного происхождения разнообразия людей с расстройством, и надеемся, связать конкретные штаммы бактерий с болезнью.
Исследователи предположили, что первоначально трансплантации помогло бы сначала очистка кишки получателя микробов антибиотиками, в соответствии с Manichanh. Но они обнаружили, что антибиотики были настолько сильны, что они мешали созданию новых микробных колоний. Крыс, которые не получают антибиотики показали больше изменений в их флоры, чем те, что сделали.

Джордж М. Вайншток , профессор генетики в Университете Вашингтона в Сент-Луисе и заместитель директора школы геноме центра, говорит, что это слишком рано говорить ли подобные трансплантации будет работать в людей, и если это так, для которых заболеваний. Хотя анекдотических эксперименты показали, что кто-то микробиомом изменение может быть лечение болезни, окончательного экспериментов не хватает, говорит он.
Дэвид А. Relman , профессор медицины и микробиологии и иммунологии в Стэнфордском университете, говорит, что это также по-прежнему, будет ли трансплантации могут быть стандартизированы для получения надежных и воспроизводимых результатов. Как чужой микробов кишки может предположительно, положительное влияние на расстройства, связанные бактериального роста, но также может иметь потенциально опасные последствия. Это новое исследование следует крыс на три месяца и обнаружили, что новые колонии микробов были стабильными. Но будущие исследования должны будут следовать реципиентов на более длительный срок, Relman говорит.

Следующим шагом в своих исследованиях, Manichanh говорит, является ли микробиомом трансплантации могут повлиять на ход болезни больного животного. Она и ее команда первый план, чтобы посмотреть на синдром раздраженной толстой кишки. Они уже работают в каталог микробного происхождения разнообразия людей с расстройством, и надеемся, связать конкретные штаммы бактерий с болезнью.

http://www.technologyreview.com/biomedicine/26178/page2/
БИОМЕДИЦИНА
: Будущее Пробиотики
Новые технологии позволят пролить свет на полезные бактерии могут помочь нашему здоровью.

ПЯТНИЦА, 14 ДЕКАБРЬ 2007ПО ЭМИЛИ ЗИНГЕРА
Пробиотики - проглатывание живых микробов для повышения здоровья, - может вызвать в воображении образы старения хиппи в лечебно-продовольственных магазинов покупке эзотерических марки йогурта. Но на самом деле возникающих объем научных данных показывает, как пробиотические лечения может благотворно влияют как миллионы микробов в нашем кишечнике и здоровье своего хозяина-человека. Ранее на этой неделе конференции, созванной Национального института здоровья обследованных состояние этой растущей области медицины. Сочетание иммунологов, микробиологов, диетологи, врачи, и даже члены Министерства обороны сошел на отель в Роквилле, Мэриленд, чтобы прояснить последствия последних клинических испытаний в пробиотиков.

Исследования животных, поднятые в стерильных средах показали, что микробы в кишечнике играют важную роль как в развитии иммунной системы и в пищеварении себя. (См. " Наша микробной Зверинец ".) Люди пытались формы этих общин в лучшую сторону есть ферментированные продукты полно бактерий, таких как йогурт, на протяжении сотен лет. Но это только недавно, что пробиотики были протестированы более строго для числа состояние здоровья, включая аллергию, болезни Крона, и диарею. Однако, поскольку эти исследования были использованы различные формулировки и были ограничены в размерах, они дали неоднозначные результаты. Как ученые, так и врачи надеются, что лучшие характеристики и понимания микробных сообществ, которые живут внутри нас может помочь сформировать и интерпретировать эти исследования, в конечном итоге выдвижением новой эры в микробных медицины.

Одним из основных препятствий на пути изучения воздействия пробиотиков является неспособность расти наиболее желудочно-кишечного микробов в лабораторных условиях. Но новые технологии, которые используют анализ ДНК, чтобы изучать микробов кишечника без культивирования них - подход, известный как metagenomics - предлагают исследователи альтернативный подход. (См. " Metagenomics Определенный . ") все большее число исследований, опубликованных в течение последних двух лет показывают потрясающие разнообразие нашей микробного населения: люди гавани от 100 до 1000 различных типов бактерий в кишках, и дополнительные виды будут обнаружены с каждым новым человеком изучены. Проекты В настоящее время ведутся изучить, как различные факторы, в том числе болезней и пробиотических лечения, форма этих общин.

Джефф Гордон , микробиолог из Университета Вашингтона в Сент-Луисе и организатор конференции, был лидером в метагеномных исследования человеческого кишечника. Он говорил с Technology Review о том, как эти новые технологии могут форме микробных Кабинета медицины будущего.




TR : мы на пороге революции в пробиотики?

JG : Я бы описать ее как быструю эволюцию. Пробиотики были вокруг в течение многих лет, и вопросы мы просим - таких, как, какие формы микробных сообществ - очень старые вопросы, которые было предложено со дня рождения микробиологии. Что изменилось, так это видов инструментов и экспериментальных систем мы должны изучить их. У нас есть новые технологии секвенирования и metagenomics, gnotobiotic [микроб-Free] животных, трансгенные мыши, и сложные методы метаболического профиля.

TR : Как эти изменения технологий, как мы думаем о пробиотики?

JG : Если мы хотим, чтобы попытаться умышленно изменять кишки микробного сообщества, мы должны лучше понять его.

Я думаю, слияния метагеномных и других факторов позволяет нам приступить к решению вопроса, то, что механизм действия? Как целом эффекты? Какое влияние они оказывают на кишечнике микробной экологии и на хозяина? У межличностные различия в кишечнике микробной экологии определить эффективность пробиотиков?

Мы изначально описания того, что микробы присутствуют на уровне организменном и ген, а затем смотрит на функции этих общин. Это обеспечит беспрецедентную возможность для определения обстоятельств, при которых человек должен потреблять жить микробы.
TR : Как это повлияет на развитие пробиотиков в качестве продуктов? Большинство современных исследований - и пробиотических-меченых продуктов - содержат только один или несколько штаммов бактерий.

JG : Мы должны думать о микробов в рамках сообщества со свойствами, которые в результате этого сообщества. Типов соединений сообщество сделает могут быть затронуты хозяина, так виды продукции могут возникнуть, что может быть очевидным, когда вы изучаете всей общины.

TR : Несколько исследований рассмотрены пробиотических лечения у беременных женщин и новорожденных, и предварительные данные свидетельствуют о том, что это может иметь долгосрочное влияние на снижение некоторых аллергию.

JG : Там может быть критическим периодом в развитии в определении в микробных профиль личности. Мы должны начать думать о том, что силы форме сообщества сборки. Там может быть динамическое взаимодействие между микробами и диеты, которые могли бы долгосрочное воздействие на хозяина.

TR : Ваш лаборатории ранее показали, что ожирение и худых имеют различия в их микробных популяций, которые влияют как эффективно продукты перевариваются. Над чем вы работаете сейчас?

JG : Моя лаборатория пытается место человеческие микробиомом кишки в контексте эволюции. Как это было форме путем эволюции? Она меняется с нашей быстро меняющейся жизни? Мы просто завершение большого глобального исследования млекопитающих кишки, в том числе видов приматов, хищников, травоядных животных, и всеядные.
http://www.technologyreview.com/biomedicine/19900/page2/
БИОМЕДИЦИНА
Генная инженерия. Пробиотики
Поворот на традиционной терапии показывает обещание для лечения заболевания кишечника.

ВТОРНИКУ, 1 ФЕВРАЛЯ 2011ПО ЭМИЛИ ЗИНГЕРА
Общественный интерес к пробиотиков находится на подъеме, если избыток рекламы пробиотических йогуртов-те с добавлением дозы полезных бактерий-какие-либо доказательства. Ученые об этой традиционной терапии в 21-ом веке генной инженерии микроорганизмов для повышения их влияние на иммунную систему. Они надеются, что новые ошибки будут в конечном счете, помочь в лечении воспалительных заболеваний кишечника, таких как болезнь Крона и неспецифический язвенный колит, а также других заболеваний, которые в результате сверхактивной иммунной системой.

В исследовании, опубликованном сегодня в Трудах Национальной академии наук , ученые удалили ген бактерии Lactobacillus Acidophilus, которые часто можно обнаружить в йогурте. Мансур Mohamadzadeh , адъюнкт-профессор медицины в Северо-западном университете, и сотрудники ранее показали, что фермент этот ген производит увеличивает воспаление, определяющей характеристикой болезни Крона и язвенного колита. Но неизменной форме бактерии также вызвал производство полезных иммунной молекулы, Ил-10М, который помогает регулировать иммунную систему. Цель инженерной микробов было доставить положительные эффекты без вредных.

Когда подается на мышах с колит и воспаление толстой кишки, инженерии бактерий предотвратить потерю веса и кровавый понос, который обычно сопровождает это условие. Кроме того, лечение мышей было на 90 процентов меньше воспаление в толстой кишке их тканей, чем их коллеги необработанной.

Хотя пробиотические продукты и добавки огромная индустрия, неясно, действительно ли они помогают лечить большинство заболеваний желудочно-кишечного. Исследования, опубликованного сегодня является частью тенденции в области микробиологии, чтобы исследовать в строгой подробно эффекты пробиотиков и механизмы, которые лежат в их основе.
"Концепция [пробиотиков] это замечательно, но доказательства их [эффективности] является довольно ограниченным", говорит Бальфура Сартор, содиректор Центра биологии и желудочно-кишечные болезни в Университете Северной Каролины, который не принимал участия в Новое исследование. Потому что пробиотики считаются продукты питания и не наркотики, они не регулируются в США продуктов питания и медикаментов, и поэтому не требуют больших клинических испытаний препаратов, что делать.

Воспалительные заболевания кишечника является одним из основных областях, представляющих интерес для пробиотических лечения, но "там действительно было мало прямых доказательств того, что пробиотики эффективны в лечении и профилактике болезни Крона", говорит Сартор. Некоторые исследования показывают, что два различных пробиотических формулировки может помочь предотвратить повторение язвенный колит, говорит он. "Но это только два из тысяч препаратов."

Ученые до сих пор не знаем точно, как пробиотические бактерии влияют на желудочно-кишечного тракта, но предыдущее исследование предлагает несколько возможных механизмов. Полезные бактерии могут временно изменить отношение хорошо вредные бактерии, которые обитают в кишечнике, или они могут специально заблокировать деятельность вредные бактерии. И пробиотики, кажется, влияние на иммунную систему, "стимулирующих защитные иммунные клетки или блокирование пагубно деятельности иммунные клетки," говорит Сартор.

Команда Mohamadzadeh ориентирована на активность иммунных клеток. Исследователи смотрел подробно на молекулярных эффектов инженерии бактерий и обнаружили, что производство нормативно иммунные клетки, а не воспалительных иммунных клеток, был усилен. "Когда мы относимся к мышам с нового штамма, мы видим больше накопления и генерации клетки, которые производят регуляторных белков, которые соблазняют и создания регуляторных Т-клеток", говорит Mohamadzadeh. Регуляторных Т-клеток, типа иммунных клеток, нейтрализации воздействия вредных иммунных клеток, которые атакуют клетки, выстилающие кишечник, говорит он.

Хотя исследования является перспективным, Сартор предупреждает, что "это огромный скачок между животных и болезней." Пробиотик лечение "не всегда имеют тот же эффект у людей, как в животных, и существует большая разница в показе защиты на животных моделях [по лечению животных, прежде чем симптомы возникают] от лечения текущего заболевания человека".

Mohamadzadeh говорит, что перед началом клинических испытаний, он планирует изучить роль больше видов поверхностных белков в инженерии бактерий, чтобы определить, какие полезны, а какие вредны. Если ученые смогут идентифицировать молекулы бактерий делать, которые помогают регулировать иммунную систему, они могут быть в состоянии разработать препараты, которые имеют подобный эффект. (Это легче для изменения и дать контролируемые дозы химических соединений, чем живые бактерии, которые могут вести себя непредсказуемо раз внутрь.)

Команда Mohamadzadeh также изучает инженерных пробиотиков для лечения рака толстой кишки. В ходе предварительных исследований на мышах предназначен для имитации рака толстой кишки, лечение измененных бактерий сократили количество полипов животных разработаны на 90 процентов. "Мы наблюдали среднем всего три небольших полипов в обработанных мышей, по сравнению с примерно 35 до 50", говорит он.

Он добавляет, что бактерии способность уменьшить воспаление не ограничивается кишки; нормативно клетки мигрировать по всему телу. Это означает, что микробы могут также быть в состоянии помочь в лечении других заболеваний, связанных с воспалением, таких как ревматоидный артрит и псориаз .

http://www.technologyreview.com/biomedicine/32249/page2/
БИОМЕДИЦИНА
Смертоносных бактерий из космического пространства
Salmonella бактерий, выращенных на космический корабль показал нечетным генетической активности, становится все более опасной.

ВТОРНИК, 25 СЕНТЯБРЯ 2007ПО КЭТРИН BOURZAC
Spaceflight, как известно, сильное влияние на физиологию человека, ослабление космонавтов костей и мышц и нарушению их иммунной системы. Новое исследование показывает, что ее воздействие на микроорганизмы могут быть столь же драматической: сальмонеллы выращивались на борту космического челнока был много раз беспощаднее, чем его земной коллегами. Исследование показывает, что НАСА и других космических агентств, возможно, должны беспокоиться, что долго пилотируемых полетов увеличится вирулентности микроорганизмов, что астронавты неизбежно носить с собой. Он также дал микробиологов понимание сальмонеллы , которые могут привести к новым методам лечения для инфекций на Земле.

Исследователи во главе с Черил Никерсон , доцент Университета штата Аризона Biodesign института, показало, что сальмонеллы выращивались в течение челнока миссии STS-115 место в 2006 году произошли кардинальные изменения в экспрессии генов из 167. При введении мышам на Земле, бактерий доказано много раз опаснее эквивалентной деформации, выращенные на земле.

Эксперимент был первым для изучения изменений в экспрессии генов микроорганизмов в космосе. Аризона ученые представили доказательства, что один конкретный Salmonella ген регулирует большинство молекулярных изменений, которые претерпел бактерий. Этот глобальный регулятор, который, кажется, помогает бактериям реагировать на стресс, становится более вирулентным, является потенциальной терапевтической мишенью для будущих Salmonella лечения.

Последствия для полетов человека в космос не так ясно. "Это не похоже, что-то NASA должны беспокоиться о том," по крайней мере в краткосрочной перспективе, говорит Дэвид Робертсон , директор Центра космической физиологии и медицины в Университете Вандербильта. Но это невозможно полностью стерилизации космических аппаратов, в основном потому, что люди проводить так много бактерий вокруг с ними: бактериальных клеток в нашем организме значительно больше, чем наши собственные. "Чем больше поездок, тем больше мы должны быть обеспокоены", говорит Робертсон. Пилотируемый полет на Марс, который был предложен президентом Бушем, займет около трех лет.




Сальмонеллы были на борту космического челнока Атлантис в своего рода анабиоза, запечатанные внутри разобщенным пробирки. Один из астронавтов активированного культур бактерий, нажав поршень в камеру, что смешанные Salmonella с питательной среды. После 24 часов, плунжера была отодвинута в другую камеру. Половина бактерии затем смешивается с более питательной среды, чтобы сохранить им жизнь, пока они не вернулись на Землю, а другая половина были смешаны с химическим фиксатором, что остановить их рост и сохранить их так, чтобы их экспрессии генов могут быть изучены после челнок приземлился.

Исследователи на местах выполняется же эксперимент по той же штамм сальмонеллы , выросли в среду, что передразнил температуры, влажности и других условий, на борту космического корабля, но был земной гравитации. По сравнению с этими бактериями, выращенными в космосе отображаются основные изменения в активности 167 генов и в производстве из 73 белков. Более низкие концентрации бактерий пространства вызвано смертельной инфекции у мышей, и пространство бактерий погибло больше мышей раньше, чем та, что выращивается на земле.

Никерсон говорит, что эти изменения могут быть из-за механических напряжений, что микрогравитации налагает на бактериальные клетки. В условиях микрогравитации, клетки в пробирке или в наши тела в "состоянии плавучесть, плавающим приостановлена", говорит она. Это приводит к изменению потока жидкости по поверхности клетки, и, следовательно, поведение клеток.
Кажется нелогичным, что исследователи могут узнать о том, как бактерии ведут себя в нашем теле на Земле, поместив их в среду искусственный, как пробирку на космический корабль, говорит Жанна Беккер , заместитель директора Национального космического института биомедицинских исследований в Хьюстоне. "Глядя на это с точки зрения бактерий", говорит она, "они хотят, чтобы иметь возможность выжить в стрессовых условиях", - будь то микрогравитации, нападения со стороны иммунной системы, или наличие антибиотиков. Пути бактерий реагировать на стрессовые окружающей среды - путем более или менее того или иного белка, например, - может указывать исследователей к биохимические пути, что роман терапия может цели.

Spaceflight также изменяет генетической активности клеток человека. "Мы произошли в среду одной тяжести", говорит Беккер. "Есть фундаментальные изменения, когда вы берете тяжести далеко." Одно исследование показало, что космический полет вызвало изменения в выражении более 1600 генов в человеческих клетках почки, выращенные в культуре. Беккер говорит, что многие исследования молекулярных эффектов космических условий на клетки предстоящего, как исследователи воспользоваться Международной космической станции.

группы Никерсон в скором времени опубликовать документы по эффектов космического полета на штамм дрожжей и синегнойной палочки , бактерии, которые вызвали только тяжелой инфекции из астронавтов на сегодняшний день, в 1970 году. Чтобы сделать успешную возвращение в атмосферу после взрыва бортовой, Аполлон-13 астронавтов отступили от основной части своего дела в их лунного модуля, где они сталкиваются не хватает кислорода, мощности и воды. В этих экстремальных условиях, астронавт Фред Хейз разработали агрессивные инфекции простаты вызванных Pseudomonas и был серьезно болен в течение нескольких недель после возвращения домой.

Большинство инфекций астронавтов в космосе были легкими - в случае Хайз является исключением - и никто не был вызван сальмонеллы . Никерсон говорит, что она выбрала для изучения сальмонеллы , поскольку ранее эксперименты, которые моделировали микрогравитации и других условиях космического предложил бактерии в вирулентность может увеличиться в пространстве. "Хотя Salmonella никогда не был изолирован от корабля, это важная причина пищевых предназначенных для Международной космической станции получает дисквалифицирован, "говорит она.

"Тот факт, что по крайней мере одну неприятную ошибку, становится явно более опасные в условиях космического полета представляет опасности, которые могут перед были недооценивается", говорит Ким Приск , профессор медицины в НАСА Лаборатории в Университете Калифорнии, Сан-Диего. "Это делает задуматься о том, как агрессивное лечение инфицированных предмета в пространстве необходимо будет".

Что более важно, скажем Приск и Беккера, является Аризона исследователей идентификации от глобального регулятора вирулентности, которые могли бы привести к лечению сальмонеллой инфекций. "Это хороший пример того, как космический полет-ориентированных исследований может привести к потенциально важные и полезные результаты здесь на земле", говорит Приск.

http://www.technologyreview.com/biomedicine/19425/page2/
БИОМЕДИЦИНА
Следующая проекта "Геном человека: Наши Микробы
Предлагаемого проекта в последовательности микроорганизмов, населяющих наш организм может иметь огромное влияние на здоровье человека.

СРЕДА, 2 МАЯ 2007ПО ЭМИЛИ ЗИНГЕРА
Многое, как мы могли бы их игнорировать, микробы колонизировали почти каждый сантиметр нашего тела, живущих в наши уста, кожи, легких и кишечнике. Действительно, человеческое тело имеет в 10 раз больше микробных клеток, как клетки человека. Они жизненно важная часть нашего здоровья, ломая в противном случае переваривается пища, что делает жизненно важных витаминов, и даже формировании нашей иммунной системы. Последние исследования показывают, что микробы играют роль в заболеваниях, таких как язвы, болезни сердца и ожирение.

Хотя микробы составляют такие интимные части из нас, большинство наших микробных жителей остаются загадкой. Бактерий в организме человека очень трудно учиться, так как только около 1 процента из них могут быть выращены в лаборатории. Теперь предлагается новый проект последовательность всех наших микробных жители могут изменить эту ситуацию.

"Это совершенно неисследованной территории, что может оказать большое влияние на наше понимание человеческого здоровья и болезни", говорит Джордж Вайншток , содиректор по правам Секвенирование центра Медицинского колледжа Бэйлора в Хьюстоне. "Мы не смогли подойти к нему из-за масштаба проблемы. Но теперь мы, наконец, в состоянии открыть эту дверь."

Благодаря постоянно совершенствующихся методов последовательности ДНК, ученые могут теперь к анализу геномов целых микробных сообществ, области, известной как metagenomics. Сравнивая микробных сообществ у людей разного возраста, происхождения, и здоровье статусов, ученые надеются выяснить, как именно микроорганизмы предотвращения или увеличение риска для определенных болезней и могут ли они быть манипулировать для улучшения здоровья.




Несколько проектов metagenomics ведутся или уже завершены, в том числе анализ микробов, живущих в кишечнике человека и на коже. Но истинный снимок нашей микробных зверинец потребует огромных усилий, а также линии проекта "Геном человека. "Даже если микробных геномов является одной тысячной размер генома человека, общее количество микробных генов в [человека] тела гораздо больше, чем гены человека, поскольку у вас так много различных видов", говорит Вайншток.

Национальные институты здоровья (NIH) в настоящее время рассматривает такой проект. Metagenomics эксперты и правительственные чиновники встретились на прошлой неделе, чтобы определить, является ли предложение, названный человеческим микробиомом, станет NIH "Дорожная карта" инициативу . Эти NIH всей программы выявления основных пробелов в области биомедицинских исследований и оказывать финансовую поддержку в гораздо большем масштабе, чем обычные грантов. Окончательное решение ожидается в этом месяце.

"В конце концов, мы в конечном итоге с другой точки зрения на эволюцию нашего вида, наш человек-микробных себя", говорит Джеффри Гордон , микробиолог из Университета Вашингтона школа медицины, в Сент-Луисе.
Недавние исследования в лаборатории намеки Гордона на потенциальное воздействие общественного здравоохранения более четкого понимания наших микробных арендаторов. Гордон и его коллеги показали, что тучные люди гавани различных микробных сообществ, чем худых. И, как людей, страдающих ожирением похудели, их микробы стали больше похожи на микробов их постное коллег.

Исследователи пока не уверены, что вызывает разногласия, но они нашли в аналогичном исследовании на мышах, что микробных популяций тучных мышей могли бы более эффективно релиз калорий из пищи в процессе пищеварения, чем может микробов их постное помета.

Хотя интересно, исследования Гордона также иллюстрирует проблемы каталогизации микробов. Чтобы по-настоящему интерпретировать человеческие микробиомом, ученые должны смотреть на изменения в микробных сообществ среди многих людей и различных групп населения. Усложняет задачу то, что, в то время как человеческий геном человека является статическим, микробный состав человека - и, следовательно, его или ее микробиомом - колеблется с течением времени. Так точную картину микробиомом одного человека может потребовать нескольких усилия resequencing.

Эти виды исследований может принести самой большой наградой, выявление ли различные организмы связаны с различными состояниями здоровья. Гордон и другие надеются, что микробные анализ в конечном счете станут обычной частью медицинских осмотров, возможно, используется для диагностики различных заболеваний.

Ученые до сих пор обсуждают ли микробиомом станет "дорожной карты" проекта, и если да, то какие конечные цели проекта будет: они должны сосредоточиться на создании полной последовательности доминирующих микробы, например, или уделять равное энергии для комплекса Задача изучения изменчивости микроорганизмов?

Тем временем, микробиологи готовятся. Три крупных центров секвенирования - Бейлор, Широкая институт, и Вашингтонского университета - собрали средства для последовательности геномов нескольких кишки микроорганизмы, которые могут быть выращены в лаборатории, которая будет иметь решающее значение в более поздних исследованиях. В конечном счете, говорит Гордон, "мы получим гораздо больше трансцендентного мнение о себе как о supraorganism с черты, приобретенные от нашей микробных партнерства".

http://www.technologyreview.com/biomedicine/18618/page2/
БИОМЕДИЦИНЕ
Расшифровка Пневмония в оборону
Исследователи последовательность более 200 штаммов ошибку и найти каталог способы их обойти лекарственных препаратов и вакцин.

ПЯТНИЦА, 28 ЯНВАРЬ 2011ПО ЭМИЛИ ЗИНГЕРА
Углубленный генетический анализ тесно связан штаммы Streptococcus пневмонии , бактерия, которая вызывает пневмонию, удалось выяснить, каким микробом постоянно избежал попытки победить его. Результаты показывают, что ошибка может легко заменить куски ДНК с другими штаммами, что позволяет ему быстро развиваться как защита от антибиотиков и вакцин. Исследователи говорят, что результаты помогут им создавать более эффективные превентивные меры и методы лечения.

"Это показывает только, как удивительно быстро эта ошибка может открывать себя заново", говорит Уильям Hanage , адъюнкт-профессор эпидемиологии в Гарварде и один из авторов исследования. "Я думаю, что выводы должны возобновить наше признание, как именно инновационные мы должны быть в поиске новых способов борьбы с заболеванием, вызываемым этим организмом, который легко способны сбросить какого-либо вмешательства мы направляем против него."

Несмотря антибиотиков и вакцин, Всемирная организация здравоохранения считает, что пневмония бактерий, известных как пневмококка, несет ответственность за около четырех миллионов смертей в год, в основном среди детей из бедных стран.

Исследователи последовательность 240 штаммов лекарственно-устойчивых форм микробов, собранные в период между 1984 и 2008 из 22 стран по всему миру. Первоначальный вариант, от которого произошли другие, как полагают, возникла около 40 лет назад в ответ на введение антибиотиков. Хотя исследователи ранее чем горстка генов в этих микробов, это исследование стало первым для анализа всего генома, что позволяет исследователям воссоздать ее эволюционного дерева. Результаты исследования были опубликованы сегодня в журнале Наука .



"Я думаю, что это ориентир бумаги", говорит Александр Томаш , профессор микробиологии в Университете Рокфеллера. Томаш способствовали некоторые из ДНК, используемые в исследовании. "Он использует самые современные методы молекулярной на [штаммов] собранных в различных местах в течение долгого времени, чтобы проследить эволюцию одного из самых важных человеческих патогенов."

Микробы могут развиваться двумя путями; через одно изменение письмо ген-кодирующей области ДНК, или путем обмена большие куски ДНК. Последний механизм встречается реже, но она способна производить гораздо больше изменений в организме, в том числе возможность уклониться от вакцины.

Новые исследования показывают, насколько общие этой замены в пневмококка бактерий. "Мы видим несколько случаев, когда клон приобрела различных элементов сопротивления, таким образом, чтобы макролидов антибиотики, в разное время и в разных частях мира", говорит Стивен Bentley , ученый Wellcome Trust Sanger Institute, и старший автор исследования.

Исследователи обнаружили, например, два варианта, которые выгружена часть их геномов, что сделало их уязвимыми для вакцины. "Это рода конвергентной эволюции параллельно рассказывает нам что-нибудь о том, как легко эти вещи могут забрать возможность избежать", говорит Hanage. "Мы знали в течение многих лет, что это произойдет. То, что мы не поняли только, сколько раз это происходит в отдельных линиях." Самая последняя версия вакцины уже обновлен и теперь включает антитела против этих штаммов.
Bentley говорит, что это еще не ясно, где новые куски ДНК и откуда, хотя они, вероятно, возникла в других видах пневмонии бактерий, населяющих ту же нишу, а именно нос.

Исследование также проливает свет на эту населения микробов развивается в ответ на введение в действие в 2000 году вакцины против семи из наиболее распространенных болезнетворных подтипов в Соединенных Штатах. Ученые уже знали, что эти подтипы были практически искоренены После вакцинации стали популярными, а другие возникли на их место. Но это не было ясно, будет ли новые варианты были представлены до 2000 года и вырос, чтобы заполнить нишу слева от тех, которые были уничтожены, или же они эволюционировали в ответ на вакцину, говорит Эрве Tettelin , доцент кафедры микробиологии и иммунологии в университете штата Мэриленд школы медицины. Ученые теперь знают, что варианты, скорее всего, существовали до 2000 года.

"Если мы понимаем, как те вещи, которые развиваются, мы сможем лучше решать на будущих вакцин и антибиотиков лечение так, что мы не хуже или вытеснять проблемы", говорит Tettelin.

Новейшая версия вакцины цели 13 из наиболее распространенных подтипов. Но, учитывая, что Существуют более чем 90 сортов этот штамм микроба, теперь исследователи предсказывают, что микробное население будет реагировать таким же образом он ответил на предыдущий вакцины.

Другой вариант заключается в разработке вакцин, в который белка общим для всех штаммов, который является жизненно важным для выживания микроорганизмов. Секвенирование исследований, таких как этого можно было бы помочь ученым определить такие белка. "Если вы последовательности сотни или тысячи геномов, это когда вы можете начать определять истинные генома основной", говорит Tettelin. "Тогда вы можете принять решение о том, что белки использовать в вакцине."

Деформации при исследовании в этот проект является лишь одним из многих болезнетворных сортов пневмококки. Bentley, Tettelin, и другие сейчас анализируем другие штаммы использованием аналогичного подхода. Исследователи также используют последовательности, чтобы выглядеть еще более тесно в эволюции бактерий. Bentley планирует провести анализ образцов, взятых из лагеря беженцев в Таиланде более 15 лет. Это должно дать гораздо более высокое разрешение, чем один текущий проект производства. Это более четкого представления, в свою очередь, помогают проследить, как ошибки передаются от человека к человеку.


http://www.technologyreview.com/biomedicine/32231/?nlid=4065
Еще одна вакцинация включена в Национальный календарь прививок 25.11.2010 [17:03] 1 66.ru
Вакцинация от гемофильной инфекции стала одиннадцатой в календаре.

Госдума приняла закон, включающий вакцинацию от гемофильной инфекции в Национальный календарь прививок, сообщает «Интерфакс». Соответствующая поправка внесена в действующий закон «Об иммунопрофилактике инфекционных болезней».
Ранее в него были включены прививки против вирусного гепатита B, туберкулеза, дифтерии, столбняка, коклюша, кори, краснухи, свинки, полиомиелита и гриппа.

Как отметила, комментируя нововведение, глава комитета Госдумы по охране здоровья Ольга Борзова, ежегодно пневмонией, вызванной гемофильной палочкой типа b (Hib), заболевают 150 из 100 тысяч российских детей, что соответствует примерно 10 тысячам случаев заболевания. Помимо этого, Hib может вызывать гнойный менингит, отит и сепсис. По данным ВОЗ, вакцинация от гемофильной инфекции в развитых странах привела к практически полному искоренению этих заболеваний.

По словам Борзовой, в РФ созданы все условия для бесплатной поголовной вакцинации детей от Hib: производится отечественная вакцина, стоимость которой составляет примерно 150 рублей, а также проведены эпидемиологические исследования для определения групп риска.

В 2011 году от гемофильной инфекции планируется привить 330 тысяч детей в возрасте до пяти лет. Финансироваться вакцинация будет из бюджета в рамках нацпроекта «Здоровье», передают «МедНовости».

В сентябре 2010 года глава Минздравсоцразвития РФ Татьяна Голикова отметила, что Минздрав также рассматривает вопрос о включении в календарь прививок вакцины против вируса папилломы человека (ВПЧ), с которым связано подавляющее большинство случаев рака шейки матки. Ранее в текущем году включить прививку от ВПЧ, а также от пневмококковой инфекции в национальный календарь предлагал Конгресс педиатров России. Однако эти инициативы реализации пока не получили.

http://www.66.ru/news/health/73658/#prn